Conception et création de solutions innovantes en bioinformatique pour l'annotation de génomes complexes

ABgenomica offre des solutions innovantes en bioinformatique pour l’annotation et l’analyse des génomes issus du séquençage à haut débit (Next Generation Sequencing). Son expertise se porte sur les génomes de haute complexité, dont les séquences comportent des spécificités qui ont besoin d'une procédure d'analyse adaptée et efficace. ABgenomica a recours au logiciel REPET développé à l'INRA pour connaître les complexités de ces génomes, ainsi qu’à une collection d’outils open sources qui permettent de construire les “workflows” les mieux adaptés aux propriétés du génome pour la suite des annotations. Le champ d'application cible les grands projets génomiques (maïs, blé, riz, colza, espèces impliquées dans les chimies vertes et biocarburants) ainsi que la médecine personnalisée. Une interface graphique est en cours de développement et sera opérationnelle courant 2010.