DECOD-AAV — Dissection des mécanismes gouvernant l'efficacité du transfert de gène dans le muscleà l'échelle du noyau unique

Les dystrophies musculaires (DM) sont des maladies génétiques dramatiques affectant le muscle squelettique, pour lesquelles il n'existe actuellement aucun traitement curatif. Les technologies de transfert de gènes basées sur des vecteurs adéno-associés (AAV) ont donné des résultats précliniques prometteurs pour le traitement de ces maladies. Cependant, le transfert sûr et efficace de matériel génétique à l'aide de ce vecteur présente encore des problèmes importants, en particulier lorsque l'approche thérapeutique nécessite l'administration systémique d'une grande quantité de virus comme dans le cas des DM. Il existe donc un besoin important de développer des stratégies plus efficaces pour transférer le matériel génétique dans les muscles squelettiques. Dans cette demande, nous proposons d'étudier les mécanismes sous-jacents à l'efficacité du transfert de gènes comme point de départ pour concevoir des stratégies ayant une efficacité accrue. Nos observations indiquent l'existence de facteurs qui vont influencer le transfert du vecteur ou l'expression du transgène dans les fibres d'un muscle par ailleurs homogène au niveau génétique. Le but de cette proposition est d'identifier ces facteurs et de tester des stratégies issues des connaissances acquises pour augmenter la transduction musculaire. Nous caractériserons tout d'abord le profil d'expression des domaines nucléaires des fibres par séquence ARN de noyau unique pour établir une corrélation avec la transduction musculaire par AAV. Nous utiliserons ensuite des techniques de transparisation du muscle entier et de transcriptomique spatiale pour examiner la corrélation entre la transduction musculaire et la position des éléments structurels du muscle. Les résultats seront ensuite utilisés pour développer des stratégies pour augmenter la transduction des muscles dans un contexte pathologique.