VIP — Immunité vasculaire des plantes

Les pathogènes vasculaires colonisent les vaisseaux des plantes à partir des racines, hydathodes ou blessures et se propagent systémiquement dans tout l’organisme, allant jusqu’à causer la mort de l’hôte ou l’infection des graines. Outre les approches prophylactiques (désinfection des graines, pratiques culturales), le meilleur moyen de contrôler l’infection reste l’usage de génotypes de plantes résistantes ou tolérantes. Le projet VIP vise à identifier et caractériser les bases génétiques de l’immunité vasculaire de la plante modèle Arabidopsis thaliana contre trois bactéries phytopathogènes d’importance économique majeure (Xanthomonas, Ralstonia, Pseudomonas). Une collection séquencée et compacte de 870 plantes homozygotes portant chacune 600 mutations EMS homozygotes (HEM) sera phénotypée pour sa résistance et sa sensibilité à ces pathogènes. Ces données phénotypiques seront intégrées avec les séquences génomiques déjà disponibles et les transcriptomes (à produire) de chaque lignée pour identifier les gènes candidats explicatifs de ces phénotypes. Une caractérisation fonctionnelle approfondie sera conduite avec un focus particulier sur les mécanismes de sensibilité communs aux deux pathogènes vasculaires étudiés. Ce projet servira de preuve de concept pour l’exploitation plus large de cette ressource génétique unique par la communauté Arabidopsis et ouvrira la porte à des cribles de génétique directe qui seraient trop coûteux ou trop complexes pour être réalisés sur les ressources TILLING ou T-DNA existantes.