BACTSQUEEZ — Inhiber le quorum sensing des bactéries phytopathogènes avec des enzymes optimisées

Les bactéries phytopathogènes sont responsables des nombreuses maladies affectant les plantes telles que les chancres, la pourriture molle ou le feu bactérien. Face aux conséquences économiques de ces pathogènes, ainsi qu'à l’émergence des bactéries résistantes aux antimicrobiens et à la toxicité de la plupart des biocides chimiques, le développement de solutions antibactériennes durables est aujourd’hui une priorité. Inhiber le quorum sensing (QS) bactérien, un mécanisme de communication utilisé par de nombreux phytopathogènes pour réguler le processus infectieux, est une piste prometteuse. Un partenaire du projet a développé une enzyme robuste (SsoPox) ciblant le QS de nombreux pathogènes basé sur des acyl-homosérines lactones (AHL). La capacité de cette enzyme, dite lactonase, pour inhiber le QS de P. aeruginosa, un pathogène humain opportuniste particulièrement menaçant pour sa capacité de résistance, a été d’abord démontrée puis améliorée par mutagénèse dirigée. Dans la continuité de ces résultats, le projet BactSqueez vise à relever un nouveau défi en étendant l’approche à la dégradation enzymatique d'AHL utilisées par des pathogènes de plantes hautement problématiques (Dickeya, Agrobacterium, Pectobacterium). Grace à un consortium pluridisciplinaire et complémentaire, impliquant des partenaires académiques et industriel, BactSqueez combinera design computationnel, ingénierie enzymatique et microbiologie végétale pour développer de nouvelles lactonases aux propriétés améliorées qui seront caractérisées au niveau biochimique et dont l'efficacité sera évaluée in vitro et in planta. Grâce à l'implication d'un partenaire industriel, les enzymes issues de BactSqueez seront destinées à des applications concrètes et permettront de limiter les intrants pharmaceutiques en agriculture en utilisant des solutions innovantes, durables et responsables. Les enzymes sont de plus absentes du secteur de l'agriculture ce qui constituera une approche de rupture dans le secteur.