JOAQUIN — Rôle de la RNase J dans le contrôle qualité des ARN chloroplastiques

Le chloroplaste capte l’énergie lumineuse et la transforme en énergie chimique, permettant ainsi la vie sur terre. Issus de cyanobactéries, ils ont gardé un génome petit mais essentiel qui est entièrement transcrit sous forme de polycistrons. Les ARN matures et fonctionnels sont spécifiquement sélectionnés au sein du transcriptome primaire grâce à un ensemble de protéines de liaison à l’ARN et des ribonucléases. Parmis tous les processus d’expression génétique dans le chloroplaste, le rôle des ARN antisens et plus largement des processus impliquant les ARN double brin sont les plus mal connus. Il est supposé qu’une des enzymes clés dans ces processus est la RNase J qui a la particularité d’être à la fois une 5’-3’ exoribonucléase et une endoribonucléase. Elle mature les extrémités 5’ des ARN et permet d’éliminer les ARN antisens néfastes qui pourraient gêner la traduction. Le but du projet JOAQUIN est de mieux comprendre ce contrôle qualité des ARN chloroplastiques en (i) identifiant l’intégralité des isoformes des ARN chloroplastiques et des ARN double brins et (ii) en déterminant le rôle exact de la RNase J dans la maturation de ce transcriptome. Une attention particulière sera portée au rôle du domaine GT-1 de la RNase J qui est une spécificité de la partie C terminale de l’enzyme chez les plantes. Nous identifierons égalements les protéines et les acides nucléiques qui co purifient avec l’enzyme.