ArTIFICE — Adaptation des champignons au fromage

Pour déterminer si l’évolution est répétable ou contingente, il faut étudier des adaptations parallèles (des évènements indépendants d’adaptation à la même niche écologique). Les champignons du fromage sont d’excellents modèles pour ce genre d’étude car plusieurs espèces ont été sélectionnées par l’Homme pour fabriquer des fromages. Ces évènements récents d’adaptation ont eu lieu sous forte sélection humaine, et sont donc idéaux pour déterminer les processus d’adaptation. De plus, les champignons sont des modèles eucaryotes avec de nombreux avantages pour des études expérimentales et génomiques. J’étudierai Geotrichum candidum pour comprendre l’histoire de sa domestication et les mécanismes d’adaptation, en utilisant des données génomiques et historiques, et des expériences au laboratoire. En comparant les résultats obtenus avec les études précédentes sur trois autres champignons du fromage, j’étudierai si ces évènements multiples d’adaptation au fromage sont convergents.