SMOL — Nouvelle stratégie d'étude structurale des petites molécules en interaction avec des complexes supramoléculaires

La résolution structurale de petites molécules dans des complexes supramoléculaires est difficilement accessible aux techniques classiques d’analyse. Nous proposons de développer une stratégie conjuguant chimie de marquage, RMN solide notamment du tritium (3HssNMR) et modélisation moléculaire (MM) pour résoudre ces structures. Notre méthode repose sur : 1) l’identification par MM de positions-clés de marquage ; 2) le marquage chimique (3H, 13C, 15N) des petites molécules ; 3) la formation d’un complexe entre ces molécules et un édifice moléculaire ; 4) la mesure par RMN des distances entre atomes marqués ; 5) à partir de ces distances, la reconstruction par MM de la structure des molécules interagissant avec le système supramoléculaire. Développée pour l’étude de nanotubes peptidiques, cette stratégie sera appliquée à des molécules d’intérêt biologique : molécules anti-amyloïdes, peptides antimicrobiens, ligands de protéines intégrales etc...