CONIDIA — caractérisation de nouveaux acteurs impliqués dans la résistance "multi-drogues" chez les champignons phytopathogènes

La résistance « multi-drogues » (MDR) affecte de nombreux traitements dans les secteurs clinique (anticancéreux, antibiotiques, antifongiques) mais aussi agricole. Chez les champignons phytopathogènes, elle réduit l'efficacité des traitements fongicides, nécessitant l'utilisation de doses plus élevées, ce qui va à l'encontre de la politique actuelle de réduction de l'utilisation des intrants. Chez le champignon responsable de la septoriose du blé, Zymoseptoria tritici, la MDR est causée par la surexpression du transporteur membranaire MFS1, qui réduit la concentration intracellulaire en fongicides. Dans notre laboratoire, des études de populations naturelles ont suggéré l'existence d'autres mécanismes moléculaires impliqués dans ce phénomène, qui pourraient conduire à des niveaux accrus de résistance. L'objectif de ce projet est de mieux comprendre ces mécanismes de résistance généraliste non encore caractérisés. Nous proposons d'utiliser des isolats évolués expérimentalement (EE) sous traitement fongicide, que nous avons déjà obtenus dans le cadre d'un autre projet. Les souches EE ont déjà été caractérisées en termes de profil de résistance et d'efflux, et le génome de certaines d'entre elles présentant des profils intéressants de MDR et d'efflux a été séquencé et analysé. L'objectif de ce projet est d’étudier cinq gènes candidats identifiés par l’analyse des génomes des souches EE en utilisant des approches génétiques et biochimiques afin de valider leur implication dans la MDR mais aussi en étudiant leur fonction biologique. La caractérisation de tous les acteurs impliqués dans la résistance généraliste chez les champignons phytopathogènes permettra de les prendre en compte dans la gestion durable de la résistance. Le projet CONIDIA ne représente probablement que le point de départ de nouvelles connaissances.