DIAZOM — Les diatomées zombies : Faire ressusciter d'anciennes spores pour étudier les adaptations à l'échelle millénaire à un environnement changeant

Le projet se focalise sur d'anciennes spores de diatomées Chaetoceros récupérées dans des carottes de sédiments marins de l'Antarctique datant de 10 000 ans, avec la possibilité de remonter encore plus loin dans le temps. Le succès sans précédent que nous avons obtenu récemment en faisant revivre ces spores offre une occasion unique d'étudier les adaptations génomiques et physiologiques à travers les échelles de temps de l'évolution dans un système vivant. Nous utiliserons des méthodologies avancées, notamment le séquençage du génome entier, la transcriptomique « spike-in » et le paléo Hi-C pour étudier comment le génome de ces spores a survécu à des périodes prolongées de dormance et reste prêt à se réactiver. Des cellules seront réactivées à partir de spores d'âges différents et leurs capacités d'adaptation aux facteurs de stress environnementaux tels que la lumière, la température, la salinité et les nutriments seront évaluées afin d'obtenir des informations sur les conditions climatiques passées, sur la base d'analyses de paléomarqueurs des mêmes carottes. La nouveauté du projet réside dans la génération de données génotype-phénotype-environnement à haute résolution à partir d'organismes vivants pour la première fois sur des échelles de temps millénaires. En intégrant ces données génomiques, physiologiques et écologiques, nous visons à améliorer notre compréhension de la manière dont une espèce marine clé s'est historiquement adaptée aux changements environnementaux, ce qui contribuera aux efforts visant à prévoir leur résilience future dans une région qui évolue rapidement en raison du changement climatique mondial. L'approche interdisciplinaire, qui combine la biologie moléculaire, la paléocéanographie et l'écophysiologie du phytoplancton, permettra d'obtenir des informations sans précédent sur les mécanismes de survie à long terme des diatomées marines et, plus généralement, sur la manière dont un génome eucaryote peut rester viable pendant des millénaires.