Explologic — Réseau de régulation de la réponse transcriptionnelle aux lésions de l'ADN (à l'échelle de la cellule unique)

Le maintien de l'intégrité du génome est essentiel au sein des méristèmes qui génèrent de nouveaux organes et tissus tout au long de la vie de la plante. Plusieurs facteurs de transcription contrôlant la réponse aux lésions de l'ADN (DDR pour DNA Damage Response) ont été identifiés. Cependant, comment et dans quel ordre ils agissent pour induire des réponses différentes dans les différents types cellulaires reste une question ouverte. L'activation coordonnée de niveaux de réponse successifs, et le contrôle différentiel de la division et de la mort cellulaire selon les types de cellule sont indispensables pour préserver la fonction méristématique en réponse aux lésions de l'ADN. Dans ce projet, nous proposons de résoudre spatialement et temporellement le réseau de régulation associé à la DDR dans le méristème racinaire. Celui-ci est généralement le premier exposé aux substances toxiques potentiellement présentes dans l'environnement, et est également essentiel à la croissance des racines, et donc de la plante entière. En combinant des techniques de génomique les plus récentes (snRNAseq et snATACseq), de biologie cellulaire (live-imaging) et de biochimie (marquage de proximité), nous reconstruirons les réseaux de régulation mis en jeu de manière cellule-spécifique. Ce modèle sera validé par des approches de génétique inverse et de biologie moléculaire (ChIP). Au-delà de la résolution spatio-temporelle de la DDR, qui est indispensable pour comprendre comment la fonction méristématique est préservée en réponse au stress, la mise en place de ces approches intégratives ouvrira la voie à des études similaires appliquées à d'autres contextes physiologiques tels que le stress thermique ou la sècheresse, ce qui permettra ainsi d'aborder les défis majeurs associés à la croissance des plantes dans le contexte du changement climatique.