Janus — Décryptage des fonctions autophagiques et non autophagiques du répertoire Atg8 chez C. elegans

La famille Atg8/LC3/GABARAP de protéines de type ubiquitine est un acteur principal de la voie de la macroautophagie, un processus de résistance au stress qui maintient l'homéostasie cellulaire en favorisant la dégradation des composants cytoplasmiques et des organelles dans les lysosomes. Les protéines Atg8 sont adressées à des vésicules à double membrane appelées autophagosomes (AP), participant à l'initiation, à la reconnaissance/séquestration des cargos et à la fermeture de la vésicule. En outre, les Atg8s fonctionnent également dans des voies non liées à l'autophagie, soit conjuguées à des vésicules à membrane unique (CASM), soit indépendamment de l'ancrage membranaire. Cependant, les mécanismes moléculaires et les régulations qui sous-tendent les rôles multiples des Atg8s ne sont pas bien compris. Le consortium Janus fédère des partenaires travaillant sur l'Autophagie, la Protéostase et le Stress, et des expertises complémentaires en biologie cellulaire, génétique, protéomique et analyses de big data. Le projet Janus explore les deux faces des fonctions de LC3/GABARAP dans la cellule et vise à caractériser les mécanismes moléculaires permettant une "fonctionnalité spatio-temporelle" dans les processus liés et non liés à l'autophagie. Janus décrira et quantifiera la variabilité et la versatilité des fonctions LC3/GABARAP. Il tire parti de C. elegans pour l'étude in vivo de plusieurs processus d'autophagie, mais aussi des processus CASM et des fonctions développementales. Ce petit animal aux multiples tissus mais avec seulement deux protéines LC3/GABARAP (six chez l'homme) favorisera l'exploration de leurs rôles spécifiques et l'élaboration d'un modèle fonctionnel pour le répertoire LC3/GABARAP. La nouveauté et l'ambition de Janus est d'obtenir une vue détaillée et complète des fonctions des protéines Atg8s et de mieux comprendre comment elles participent à la détection du stress et à l'homéostasie par le biais de processus liés ou non à l'autophagie.