ABiSYM — Symbioses inter-domaine archées-bactéries pour déchiffrer l'eucaryogénèse

Des progrès en microbiologie environnementale, métagénomique et phylogénomique suggèrent que la cellule eucaryote a évolué à partir de consortia symbiotiques impliquant une archée de type Asgard et, au minimum, l’alphaprotéobactérie ancêtre de la mitochondrie. Toutefois, beaucoup de gènes d’origine procaryote chez le dernier ancêtre commun eucaryote ne s’affilient ni aux archées ni aux alphaprotéobactéries. Afin de déchiffrer leur origine, il est essentiel de mieux comprendre l’écologie microbienne des consortia symbiotiques des archées Asgard et déterminer quelles sont les lignées bactériennes avec lesquelles elles interagissent dans les écosystèmes naturels. Dans ce projet, nous combinerons des approches métagénomiques, de cellule unique, de microscopie et de culture pour identifier les partenaires symbiotiques des archées Asgard dans des environnements à transition redox, tout en caractérisant leurs interactions métaboliques. A travers l’étude des lignées bactériennes privilégiées dans ces consortiums et celles qui coexistent avec les archées Asgard au sein de l’écosystème microbien, nous espérons identifier les lignées donneuses potentielles de gènes bactériens à l’ancêtre des eucaryotes. Ainsi, ce projet nous permettra d’affiner les modèles actuels sur l’eucaryogénèse.