ENDOSEPSIS — Importance de la présence de 2 hydroxymyristate sur la structure des lipides A dans la pathogénèse du sepsis néonatal à Enterobacter species.

Enterobacter est un pathogène reconnu de sepsis fulminant chez le nouveau-né ainsi que chez les patients immunosupprimés. Nous avons récemment montré qu'une modification structurale du lipide A des endotoxines d'Enterobacter, plus précisément la présence de 2-hydroxymyristate (2-HM), est associée à une sur-mortalité néonatale lors de sepsis à Enterobacter. L'hypothèse de travail de cette proposition de recherche est que 1) 2-HM interfère avec la réponse de l'hôte 2) de manière spécifique en fonction de certaines caractéristiques immunologiques et/ou développementales de l’hôte. Afin de confirmer cette hypothèse deux cohortes ont été constituées et seront étudiées: la première (SENSE-cohorte nationale multicentrique) regroupe les caractéristiques cliniques ainsi que 88 souches d'Enterobacter responsables de bactériémies chez des nouveau-nés. La seconde (SEPSIS-cohorte) a été constituée au Bénin par un consortium regroupant le CNRS, l'IRD et bioMérieux et regroupe le suivit clinique, immunologique, microbiologique de 580 nourrissons dont 180 ayant développé un sepsis néonatal. Notre projet utilisera comme modèle Enterobacter et sera étendu à deux autres pathogènes possédant 2-HM, soit Klebisella pneumoniae et Serratia marcencens. Notre projet s'articulera autour de trois workpackage: WP1. Caractérisation génotypique et phénotypique des souches d’enterobacteries isolees de bactériémies, et caractérisation de la réponse transcriptomique de l’hôte ; WP 2. Rôle des modifications structurales du lipide A sur la réponse de l’hôte ; et WP 3. Validation fonctionnelle des gènes candidats. Ce projet devrait nous apporter des connaissances nouvelles sur le rôle fonctionnel des modifications de structures des endotoxines et leur rôle dans la physiopathologie des sepsis à Bactéries à Gram négatif.